银行透支是指客户在银行账户上透支使用超过账户中的存款金额。透支金额的计算方法和费用的收取方式可能因银行和地区而异，以下是一般情况下的概述。

首先，透支金额通常会受到银行的信用评估和客户的信用记录等因素的影响。如果客户的信用记录良好，银行可能会提供一定的透支额度，以便客户在需要时可以超出账户余额进行消费。透支额度一般是根据客户的收入、财务状况以及与银行的关系等因素来确定的。

其次，银行透支一般会收取利息费用。透支利息的计算方式通常是按照透支金额和透支天数来计算的。银行会根据设定的利率，将透支金额乘以透支天数，然后乘以日利率或月利率来计算透支利息。具体的利率和计算方式可能因银行和地区而异。

在逾期未还的情况下，银行可能会对透支金额收取额外的罚息或滞纳金。罚息和滞纳金的具体金额和收取方式可能因银行和地区而异。

总之，银行透支三个元两年未还的具体金额需要根据透支金额、透支利率、透支天数以及可能的罚息或滞纳金等因素来计算。建议您咨询相关银行机构以获得准确的计算结果。